耿运琪，男，1947年11月出生，南开大学生命科学学院教授，博士生导师。

耿运琪教授1975年毕业于南开大学生物系微生物学专业，1981-1982年在日本东京大学参加微生物学研究生班学习，1990-1991年在美国Kansas大学作访问学者，回国后一直从事HIV及相关病毒分子生物学研究，1994年被授予天津市中青年授衔专家。

耿运琪教授曾任南开大学生命科学学院副院长，院长，兼分子生物学研究所所长，南开大学副校长等职。

现任天津国际生物医药联合研究院副院长，微生物功能基因组学与检测技术教育部工程研究中心主任，兼任国务院学位委员会学科评议组成员，南开大学学位委员会副主席，教育部高等学校生物科学与工程教学指导委员会委员，教育部科学技术委员会委员、生物学部委员，科技部国家奖励评审专家委员会委员，国家纳米技术与工程研究院副理事长，中国生化与分子生物学学会常务理事，天津生化与分子生物学学会理事长，天津专家协会副会长，协和医科大学血液学国家重点实验室、军事医学科学院微生物生物安全国家重点实验室、武汉大学/中科院武汉病毒所病毒学国家重点实验室、中国CDC传染病预防控制国家重点实验室、厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室、复旦大学医学分子病毒学教育部重点实验室、吉林大学分子酶学工程教育部重点实验室学术委员会委员。

《病毒学报》、《中国病毒学》、《医学分子生物学报》、《中国生物化学与分子生物学报》、《微生物与感染》、《Frontiers of Biology in China》杂志编委，《生命世界》杂志副主编等职。

其研究方向为分子病毒学，在慢病毒基因组结构与功能，基因表达调控机制，超感染机理，抗AIDS药物筛选模型，嵌合病毒疫苗，泡沫病毒基因工程载体研究等方面取得系列成果，先后在J.virology、Virology、AIDS、Arch.Virology、J.Medical Primtology、Cellular Signalling、科学通报、病毒学报等国内外核心刊物发表学术论文１００余篇，出版学术著作两部；获省部级科技进步二等奖和科技发明二等奖各1项; 指导博士后、培养博士、硕士研究生40余名。